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生物信息学算法工程师简历模板

花友 上传于 2020-01-31 15:59

生物信息学算法工程师简历模板》

【个人信息】

姓名:李明轩

性别:男

年龄:28岁

联系方式:+86-138-XXXX-XXXX

电子邮箱:limingxuan@bioinfo.com

求职意向:生物信息学算法工程师

期望薪资:25K-35K/月

工作地点:北京/上海/深圳

到岗时间:1个月内

【教育背景】

2015.09-2020.06 清华大学 生物信息学博士

主修课程:计算生物学、基因组学、系统生物学、机器学习、统计遗传学

博士论文:《基于深度学习的多组学数据整合分析方法研究》

2011.09-2015.06 中国科学技术大学 生物技术学士

GPA:3.8/4.0(专业前5%)

荣誉奖项:国家奖学金(2014)、校级优秀毕业生

【专业技能】

编程语言:Python(精通)、R(熟练)、Perl(基础)、C++(基础)

生物信息工具:BWA、GATK、Samtools、PLINK、DESeq2、Cytoscape

机器学习框架:TensorFlow、PyTorch、Scikit-learn、XGBoost

数据库管理:MySQL、MongoDB、Neo4j

云计算平台:AWS(EC2/S3/Lambda)、阿里云(ECS/OSS)

高通量测序分析:全基因组测序、转录组测序、表观遗传组学

算法开发:序列比对、变异检测、基因表达调控网络构建

可视化工具:ggplot2、Matplotlib、Seaborn、D3.js

英文能力:CET-6(623分)、雅思7.5分、可熟练阅读英文文献

【项目经验】

项目一:基于深度学习的癌症驱动基因预测系统(2019.03-2020.05)

角色:核心算法工程师

技术栈:Python/TensorFlow/PyTorch/TCGA数据库

成果:

• 开发了融合多组学数据的深度学习模型(CNN+LSTM),准确率提升12%

• 构建了包含5000+癌症样本的标准化数据集,覆盖33种癌症类型

• 发表SCI论文1篇(IF=8.3),申请软件著作权1项

• 系统被3家三甲医院采用用于临床辅助诊断

项目二:农业作物基因组选择育种平台(2018.06-2019.02)

角色:算法负责人

技术栈:R/ASReml/GWAS/BLUP

成果:

• 开发了基于全基因组预测(GWP)的育种值评估算法,预测精度达0.85

• 构建了包含10万+SNP标记的水稻基因组数据库

• 缩短育种周期30%,降低田间试验成本40%

• 平台获省科技进步二等奖

项目三:单细胞转录组数据分析流水线(2017.09-2018.05)

角色:全栈工程师

技术栈:Python/Snakemake/Docker/AWS

成果:

• 设计了从原始测序数据到细胞类型注释的全自动流程

• 集成Seurat、Scanpy等10+主流分析工具

• 处理效率提升5倍,资源消耗降低60%

• 代码开源获GitHub 500+星标

【工作经历】

2020.07-至今 深圳华大基因研究院 高级生物信息工程师

职责:

• 领导5人团队开发下一代测序(NGS)数据分析平台

• 优化变异检测算法,将假阳性率从5%降至1.2%

• 建立自动化CI/CD流程,版本迭代周期缩短40%

• 培训20+名新员工掌握生物信息分析技能

业绩:

• 主导开发的产品服务100+家科研机构

• 申请发明专利3项(已授权1项)

• 获2021年度"优秀技术骨干"称号

2018.03-2018.08 北京基因组研究所 实习研究员

职责:

• 参与中国十万人基因组计划(China MAP)

• 开发基于GPU加速的序列比对算法

• 处理超过5000例全基因组数据

成果:

• 算法速度提升8倍,获研究所技术创新奖

• 相关成果发表于《Nature Genetics》

【科研成果】

论文发表(第一作者/通讯作者):

1. "Deep learning enables accurate prediction of driver genes in cancer"(Nature Communications, 2020, IF=14.9)

2. "Genomic prediction of breeding values in rice using machine learning"(Plant Biotechnology Journal, 2019, IF=8.5)

3. "A scalable pipeline for single-cell RNA-seq analysis"(Bioinformatics, 2018, IF=6.9)

会议报告:

• 2021年国际生物信息学大会(ISMB)口头报告

• 2020年中国生物信息学年会(CBC)特邀报告

• 2019年亚洲计算生物学会议(ACBC)分会场主席

【证书与培训】

• 阿里云ACP认证(大数据分析师)

• AWS认证解决方案架构师(Associate)

• Coursera《机器学习》专项课程(斯坦福大学,成绩98%)

• 生信技能树《转录组分析实战》认证

• 国家二级计算机等级考试(优秀)

【自我评价】

1. 扎实的生物信息学理论基础与丰富的实战经验,熟悉从原始数据到生物学发现的完整分析流程

2. 精通多种编程语言和生物信息工具,具备独立开发复杂算法的能力

3. 优秀的科研素养,以第一作者发表3篇SCI论文(总IF=30.3),H指数=5

4. 良好的团队协作能力,曾担任项目负责人带领跨学科团队完成多个重大项目

5. 持续学习意识强,关注AI+生物医药前沿技术,定期参加学术会议和培训

6. 英语听说读写流利,可无障碍进行国际学术交流

【附加信息】

开源贡献:

• GitHub: github.com/limxuan(5个开源项目,累计star 1200+)

• Bioconductor包开发者(贡献2个R包)

技术博客:

• 撰写生物信息学教程50+篇,月均访问量2万+

• 知乎生物信息学领域优质创作者(粉丝1.5万)

社会活动:

• 中国生物信息学会(CBI)会员

• 清华大学校友会生物信息分会理事

• 2021年生物信息学夏令营导师

关键词:生物信息学、算法工程师、深度学习、基因组学、转录组学、Python、R语言、机器学习、高通量测序、多组学整合癌症基因组农业育种单细胞分析AWS云计算、TensorFlow、PyTorch、GWAS变异检测数据可视化

简介:本文是一份完整的生物信息学算法工程师求职简历模板,涵盖教育背景、专业技能、项目经验、工作经历、科研成果等核心模块。申请人拥有清华大学博士学历,5年生物信息领域研究经验,精通Python/R编程和机器学习框架,主导开发过多个获得行业认可的算法平台,发表3篇SCI论文(总IF=30.3),具备从原始测序数据处理到生物学发现的完整能力链,适合生物科技公司、科研院所的算法研发岗位。